TAF5

TAF5
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2NXP
Ідентифікатори
Символи	TAF5, TAF2D, TAFII100, TAF(II)100, TAFII-100, TATA-box binding protein associated factor 5
Зовнішні ІД	OMIM: 601787 MGI: 2442144 HomoloGene: 5064 GeneCards: TAF5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein dimerization activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • histone acetyltransferase activity; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • identical protein binding; • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity;
Клітинна компонента	• ядерце; • actin cytoskeleton; • клітинне ядро; • transcription factor TFTC complex; • transcription factor TFIID complex; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• ДНК-матрична транскрипція; • DNA-templated transcription, initiation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase II; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • snRNA transcription by RNA polymerase II; • regulation of signal transduction by p53 class mediator; • histone acetylation; • GO:0022415 viral process; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6877
	226182
	ENSG00000148835
	ENSMUSG00000025049
	Q15542
	Q8C092
	NM_006951; NM_139052
	NM_177342
	NP_008882; NP_620640
	NP_796316
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TAF5 (англ. TATA-box binding protein associated factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 800 амінокислот, а молекулярна маса — 86 830^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAALAEEQTE	VAVKLEPEGP	PTLLPPQAGD	GAGEGSGGTT	NNGPNGGGGN
VAASSSTGGD	GGTPKPTVAV	SAAAPAGAAP	VPAAAPDAGA	PHDRQTLLAV
LQFLRQSKLR	EAEEALRREA	GLLEEAVAGS	GAPGEVDSAG	AEVTSALLSR
VTASAPGPAA	PDPPGTGASG	ATVVSGSASG	PAAPGKVGSV	AVEDQPDVSA
VLSAYNQQGD	PTMYEEYYSG	LKHFIECSLD	CHRAELSQLF	YPLFVHMYLE
LVYNQHENEA	KSFFEKFHGD	QECYYQDDLR	VLSSLTKKEH	MKGNETMLDF
RTSKFVLRIS	RDSYQLLKRH	LQEKQNNQIW	NIVQEHLYID	IFDGMPRSKQ
QIDAMVGSLA	GEAKREANKS	KVFFGLLKEP	EIEVPLDDED	EEGENEEGKP
KKKKPKKDSI	GSKSKKQDPN	APPQNRIPLP	ELKDSDKLDK	IMNMKETTKR
VRLGPDCLPS	ICFYTFLNAY	QGLTAVDVTD	DSSLIAGGFA	DSTVRVWSVT
PKKLRSVKQA	SDLSLIDKES	DDVLERIMDE	KTASELKILY	GHSGPVYGAS
FSPDRNYLLS	SSEDGTVRLW	SLQTFTCLVG	YKGHNYPVWD	TQFSPYGYYF
VSGGHDRVAR	LWATDHYQPL	RIFAGHLADV	NCTRFHPNSN	YVATGSADRT
VRLWDVLNGN	CVRIFTGHKG	PIHSLTFSPN	GRFLATGATD	GRVLLWDIGH
GLMVGELKGH	TDTVCSLRFS	RDGEILASGS	MDNTVRLWDA	IKAFEDLETD
DFTTATGHIN	LPENSQELLL	GTYMTKSTPV	VHLHFTRRNL	VLAAGAYSPQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Tanese N., Saluja D., Vassallo M.F., Chen J.-L., Admon A. (1996). Molecular cloning and analysis of two subunits of the human TFIID complex: hTAFII130 and hTAFII100. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 13611—13616. PMID 8942982 doi:10.1073/pnas.93.24.13611
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Damania B., Alwine J.C. (1996). TAF-like function of SV40 large T antigen. Genes Dev. 10: 1369—1381. PMID 8647434 doi:10.1101/gad.10.11.1369
Brand M., Yamamoto K., Staub A., Tora L. (1999). Identification of TATA-binding protein-free TAFII-containing complex subunits suggests a role in nucleosome acetylation and signal transduction. J. Biol. Chem. 274: 18285—18289. PMID 10373431 doi:10.1074/jbc.274.26.18285
Cavusoglu N., Brand M., Tora L., van Dorsselaer A. (2003). Novel subunits of the TATA binding protein free TAFII-containing transcription complex identified by matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry following one-dimensional gel electrophoresis. Proteomics. 3: 217—223. PMID 12601814 doi:10.1002/pmic.200390030
Bhattacharya S., Takada S., Jacobson R.H. (2007). Structural analysis and dimerization potential of the human TAF5 subunit of TFIID. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104: 1189—1194. PMID 17227857 doi:10.1073/pnas.0610297104

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11539 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q15542 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 10

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11539 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q15542 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]