CNBP

CNBP
Ідентифікатори
Символи	CNBP, CNBP1, DM2, PROMM, RNF163, ZCCHC22, ZNF9, CCHC-type zinc finger nucleic acid binding protein
Зовнішні ІД	OMIM: 116955 MGI: 88431 HomoloGene: 2567 GeneCards: CNBP
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми • зв'язування з нуклеїновими кислотами • зв'язування з іонами цинку • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв’язування з іоном металу • зв'язування з ДНК • single-stranded DNA binding • single-stranded RNA binding • RNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • mRNA binding • translation regulator activity Клітинна компонента • клітинне ядро • цитоплазма • ендоплазматичний ретикулум • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cholesterol biosynthetic process • ДНК-матрична транскрипція • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • positive regulation of cell population proliferation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of cytoplasmic translation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7555	12785
Ensembl	ENSG00000169714	ENSMUSG00000030057
UniProt	P62633	P53996
RefSeq (мРНК)	NM_003418 NM_001127192 NM_001127193 NM_001127194 NM_001127195 NM_001127196	NM_001109745 NM_001109746 NM_013493 NM_001347325 NM_001355195
RefSeq (білок)	NP_001120664 NP_001120665 NP_001120666 NP_001120667 NP_001120668 NP_003409	NP_001103215 NP_001103216 NP_001334254 NP_038521 NP_001342124
Локус (UCSC)	Хр. 3: 129.17 – 129.18 Mb	Хр. 6: 87.82 – 87.83 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CNBP (англ. CCHC-type zinc finger nucleic acid binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 177 амінокислот, а молекулярна маса — 19 463.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSNECFKCG		RSGHWARECP		TGGGRGRGMR		SRGRGGFTSD		RGFQFVSSSL
PDICYRCGES		GHLAKDCDLQ		EDACYNCGRG		GHIAKDCKEP		KREREQCCYN
CGKPGHLARD		CDHADEQKCY		SCGEFGHIQK		DCTKVKCYRC		GETGHVAINC
SKTSEVNCYR		CGESGHLARE		CTIEATA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• Rajavashisth T.B., Taylor A.K., Andalibi A., Svenson K.L., Lusis A.J. (1989). Identification of a zinc finger protein that binds to the sterol regulatory element. Science. 245: 640—643. PMID 2562787 doi:10.1126/science.2562787
• Flink I.L., Morkin E. (1995). Organization of the gene encoding cellular nucleic acid-binding protein. Gene. 163: 279—282. PMID 7590281 doi:10.1016/0378-1119(95)00421-2
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 3