RFX1

RFX1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1DP7
Ідентифікатори
Символи	RFX1, EFC, RFX, regulatory factor X1
Зовнішні ІД	OMIM: 600006 MGI: 105982 HomoloGene: 2189 GeneCards: RFX1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • зв'язування з ДНК • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity Клітинна компонента • внутрішньоклітинна мембранна органела • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • ДНК-матрична транскрипція • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 регуляція транскрипції РНК-полімеразою II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5989	19724
Ensembl	ENSG00000132005 ENSG00000288283	ENSMUSG00000031706
UniProt	P22670	P48377
RefSeq (мРНК)	NM_002918	NM_009055
RefSeq (білок)	NP_002909	NP_033081
Локус (UCSC)	Хр. 19: 13.96 – 14.01 Mb	Хр. 8: 84.79 – 84.82 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RFX1 (англ. Regulatory factor X1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 979 амінокислот, а молекулярна маса — 104 758.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATQAYTELQ		AAPPPSQPPQ		APPQAQPQPP		PPPPPAAPQP		PQPPTAAATP
QPQYVTELQS		PQPQAQPPGG		QKQYVTELPA		VPAPSQPTGA		PTPSPAPQQY
IVVTVSEGAM		RASETVSEAS		PGSTASQTGV		PTQVVQQVQG		TQQRLLVQTS
VQAKPGHVSP		LQLTNIQVPQ		QALPTQRLVV		QSAAPGSKGG		QVSLTVHGTQ
QVHSPPEQSP		VQANSSSSKT		AGAPTGTVPQ		QLQVHGVQQS		VPVTQERSVV
QATPQAPKPG		PVQPLTVQGL		QPVHVAQEVQ		QLQQVPVPHV		YSSQVQYVEG
GDASYTASAI		RSSTYSYPET		PLYTQTASTS		YYEAAGTATQ		VSTPATSQAV
ASSGSMPMYV		SGSQVVASST		STGAGASNSS		GGGGSGGGGG		GGGGGGGGGS
GSTGGGGSGA		GTYVIQGGYM		LGSASQSYSH		TTRASPATVQ		WLLDNYETAE
GVSLPRSTLY		CHYLLHCQEQ		KLEPVNAASF		GKLIRSVFMG		LRTRRLGTRG
NSKYHYYGLR		IKASSPLLRL		MEDQQHMAMR		GQPFSQKQRL		KPIQKMEGMT
NGVAVGQQPS		TGLSDISAQV		QQYQQFLDAS		RSLPDFTELD		LQGKVLPEGV
GPGDIKAFQV		LYREHCEAIV		DVMVNLQFTL		VETLWKTFWR		YNLSQPSEAP
PLAVHDEAEK		RLPKAILVLL		SKFEPVLQWT		KHCDNVLYQG		LVEILIPDVL
RPIPSALTQA		IRNFAKSLES		WLTHAMVNIP		EEMLRVKVAA		AGAFAQTLRR
YTSLNHLAQA		ARAVLQNTAQ		INQMLSDLNR		VDFANVQEQA		SWVCRCEDRV
VQRLEQDFKV		TLQQQNSLEQ		WAAWLDGVVS		QVLKPYQGSA		GFPKAAKLFL
LKWSFYSSMV		IRDLTLRSAA		SFGSFHLIRL		LYDEYMYYLI		EHRVAQAKGE
TPIAVMGEFA		NLATSLNPLD		PDKDEEEEEE		EESEDELPQD		ISLAAGGESP
ALGPETLEPP		AKLARTDARG		LFVQALPSS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Safrany G., Perry R.P. (1993). Transcription factor RFX1 helps control the promoter of the mouse ribosomal protein-encoding gene rpL30 by binding to its alpha element. Gene. 132: 279—283. PMID 8224874 doi:10.1016/0378-1119(93)90208-K
• Sanchez-Herrero C., Reith W., Silacci P., Mach B. (1992). The DNA-binding defect observed in major histocompatibility complex class II regulatory mutants concerns only one member of a family of complexes binding to the X boxes of class II promoters. Mol. Cell. Biol. 12: 4076—4083. PMID 1508204

Див. також

• Хромосома 19