SMAD9

SMAD9
Ідентифікатори
Символи	SMAD9, MADH6, MADH9, PPH2, SMAD8, SMAD8A, SMAD8B, SMAD8/9, SMAD family member 9
Зовнішні ІД	OMIM: 603295 MGI: 1859993 HomoloGene: 21198 GeneCards: SMAD9
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з ДНК • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв’язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • SMAD protein complex • регуляторний транскрипційний комплекс • внутрішньоклітинний • нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • ureteric bud development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • SMAD protein signal transduction • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • hindbrain development • cellular response to BMP stimulus • BMP signaling pathway • ДНК-матрична транскрипція • protein phosphorylation • cartilage development • bone development • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • midbrain development • GO:0007329 positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in cellular response to chemical stimulus Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4093	55994
Ensembl	ENSG00000120693	ENSMUSG00000027796
UniProt	O15198	Q9JIW5
RefSeq (мРНК)	NM_001127217 NM_005905 NM_001378621	NM_019483
RefSeq (білок)	NP_001120689 NP_005896 NP_001365550	NP_062356
Локус (UCSC)	Хр. 13: 36.84 – 36.92 Mb	Хр. 3: 54.66 – 54.71 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SMAD9 (англ. SMAD family member 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 467 амінокислот, а молекулярна маса — 52 493.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHSTTPISSL		FSFTSPAVKR		LLGWKQGDEE		EKWAEKAVDS		LVKKLKKKKG
AMDELERALS		CPGQPSKCVT		IPRSLDGRLQ		VSHRKGLPHV		IYCRVWRWPD
LQSHHELKPL		ECCEFPFGSK		QKEVCINPYH		YRRVETPVLP		PVLVPRHSEY
NPQLSLLAKF		RSASLHSEPL		MPHNATYPDS		FQQPPCSALP		PSPSHAFSQS
PCTASYPHSP		GSPSEPESPY		QHSVDTPPLP		YHATEASETQ		SGQPVDATAD
RHVVLSIPNG		DFRPVCYEEP		QHWCSVAYYE		LNNRVGETFQ		ASSRSVLIDG
FTDPSNNRNR		FCLGLLSNVN		RNSTIENTRR		HIGKGVHLYY		VGGEVYAECV
SDSSIFVQSR		NCNYQHGFHP		ATVCKIPSGC		SLKVFNNQLF		AQLLAQSVHH
GFEVVYELTK		MCTIRMSFVK		GWGAEYHRQD		VTSTPCWIEI		HLHGPLQWLD
KVLTQMGSPH		NPISSVS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Massague J. (1998). TGF-beta signal transduction. Annu. Rev. Biochem. 67: 753—791. PMID 9759503 doi:10.1146/annurev.biochem.67.1.753
• Verschueren K., Huylebroeck D. (1999). Remarkable versatility of Smad proteins in the nucleus of transforming growth factor-beta activated cells. Cytokine Growth Factor Rev. 10: 187—199. PMID 10647776 doi:10.1016/S1359-6101(99)00012-X
• Wrana J.L., Attisano L. (2000). The Smad pathway. Cytokine Growth Factor Rev. 11: 5—13. PMID 10708948 doi:10.1016/S1359-6101(99)00024-6
• Miyazono K. (2000). TGF-beta signaling by Smad proteins. Cytokine Growth Factor Rev. 11: 15—22. PMID 10708949 doi:10.1016/S1359-6101(99)00025-8

Див. також

• Хромосома 13