TAF4B

TAF4B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1H3O, 2P6V
Ідентифікатори
Символи	TAF4B, SPGF13, TAF2C2, TAFII105, TATA-box binding protein associated factor 4b
Зовнішні ІД	OMIM: 601689 MGI: 2152345 HomoloGene: 28266 GeneCards: TAF4B
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • зв'язування з ДНК; • NF-kappaB binding; • активність гетеродимеризації білків; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • зв'язування з фактором транскрипції; • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • fibrillar center; • transcription factor TFIID complex;
Біологічний процес	• DNA-templated transcription, initiation; • диференціація клітин; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase II; • Сперматогенез; • ДНК-матрична транскрипція; • Оогенез; • regulation of signal transduction by p53 class mediator; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • RNA polymerase II preinitiation complex assembly;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6875
	72504
	ENSG00000141384
	ENSMUSG00000054321
	Q92750
	G5E8Z2
	NM_001293725; NM_005640
	NM_001100449; NM_001369357; NM_001369358
	NP_001280654; NP_005631
	NP_001093919; NP_001356286; NP_001356287
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TAF4B (англ. TATA-box binding protein associated factor 4b) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 862 амінокислот, а молекулярна маса — 91 091^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPAGLTEPAG	AAPPAAVSAS	GTVTMAPAGA	LPVRVESTPV	ALGAVTKAPV
SVCVEPTASQ	PLRSPVGTLV	TKVAPVSAPP	KVSSGPRLPA	PQIVAVKAPN
TTTIQFPANL	QLPPGTVLIK	SNSGPLMLVS	PQQTVTRAET	TSNITSRPAV
PANPQTVKIC	TVPNSSSQLI	KKVAVTPVKK	LAQIGTTVVT	TVPKPSSVQS
VAVPTSVVTV	TPGKPLNTVT	TLKPSSLGAS	STPSNEPNLK	AENSAAVQIN
LSPTMLENVK	KCKNFLAMLI	KLACSGSQSP	EMGQNVKKLV	EQLLDAKIEA
EEFTRKLYVE	LKSSPQPHLV	PFLKKSVVAL	RQLLPNSQSF	IQQCVQQTSS
DMVIATCTTT	VTTSPVVTTT	VSSSQSEKSI	IVSGATAPRT	VSVQTLNPLA
GPVGAKAGVV	TLHSVGPTAA	TGGTTAGTGL	LQTSKPLVTS	VANTVTTVSL
QPEKPVVSGT	AVTLSLPAVT	FGETSGAAIC	LPSVKPVVSS	AGTTSDKPVI
GTPVQIKLAQ	PGPVLSQPAG	IPQAVQVKQL	VVQQPSGGNE	KQVTTISHSS
TLTIQKCGQK	TMPVNTIIPT	SQFPPASILK	QITLPGNKIL	SLQASPTQKN
RIKENVTSCF	RDEDDINDVT	SMAGVNLNEE	NACILATNSE	LVGTLIQSCK
DEPFLFIGAL	QKRILDIGKK	HDITELNSDA	VNLISQATQE	RLRGLLEKLT
AIAQHRMTTY	KASENYILCS	DTRSQLKFLE	KLDQLEKQRK	DLEEREMLLK
AAKSRSNKED	PEQLRLKQKA	KELQQLELAQ	IQHRDANLTA	LAAIGPRKKR
PLESGIEGLK	DNLLASGTSS	LTATKQLHRP	RITRICLRDL	IFCMEQEREM
KYSRALYLAL	LK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Wu Y., Lu Y., Hu Y., Li R. (2005). Cyclic AMP-dependent modification of gonad-selective TAF(II)105 in a human ovarian granulosa cell line. J. Cell. Biochem. 96: 751—759. PMID 16088961 doi:10.1002/jcb.20577
Dikstein R., Zhou S., Tjian R. (1996). Human TAFII 105 is a cell type-specific TFIID subunit related to hTAFII130. Cell. 87: 137—146. PMID 8858156 doi:10.1016/S0092-8674(00)81330-6
Wolstein O., Silkov A., Revach M., Dikstein R. (2000). Specific interaction of TAFII105 with OCA-B is involved in activation of octamer-dependent transcription. J. Biol. Chem. 275: 16459—16465. PMID 10828057 doi:10.1074/jbc.275.22.16459
Yamit-Hezi A., Nir S., Wolstein O., Dikstein R. (2000). Interaction of TAFII105 with selected p65/RelA dimers is associated with activation of subset of NF-kappa B genes. J. Biol. Chem. 275: 18180—18187. PMID 10849440 doi:10.1074/jbc.275.24.18180
Rashevsky-Finkel A., Silkov A., Dikstein R. (2001). A composite nuclear export signal in the TBP-associated factor TAFII105. J. Biol. Chem. 276: 44963—44969. PMID 11567023 doi:10.1074/jbc.M106112200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11538 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q92750 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 18

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11538 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q92750 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]