SOX30

SOX30
Ідентифікатори
Символи	SOX30, SRY-box 30, SRY-box transcription factor 30
Зовнішні ІД	OMIM: 606698 MGI: 1341157 HomoloGene: 34027 GeneCards: SOX30
Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding; • зв'язування з ДНК; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро;
Біологічний процес	• response to corticosteroid; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • ДНК-матрична транскрипція; • Сперматогенез; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 регуляція транскрипції РНК-полімеразою II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	11063
	214105
	ENSG00000039600
	ENSMUSG00000040489
	O94993
	Q8CGW4
	NM_001308165; NM_007017; NM_178424
	NM_173384
	NP_001295094; NP_008948; NP_848511
	NP_775560
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SOX30 (англ. SRY-box 30) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 753 амінокислот, а молекулярна маса — 81 854^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MERARPEPPP	QPRPLRPAPP	PLPVEGTSFW	AAAMEPPPSS	PTLSAAASAT
LASSCGEAVA	SGLQPAVRRL	LQVKPEQVLL	LPQPQAQNEE	AAASSAQARL
LQFRPDLRLL	QPPTASDGAT	SRPELHPVQP	LALHVKAKKQ	KLGPSLDQSV
GPRGAVETGP	RASRVVKLEG	PGPALGYFRG	DEKGKLEAEE	VMRDSMQGGA
GKSPAAIREG	VIKTEEPERL	LEDCRLGAEP	ASNGLVHGSA	EVILAPTSGA
FGPHQQDLRI	PLTLHTVPPG	ARIQFQGAPP	SELIRLTKVP	LTPVPTKMQS
LLEPSVKIET	KDVPLTVLPS	DAGIPDTPFS	KDRNGHVKRP	MNAFMVWARI
HRPALAKANP	AANNAEISVQ	LGLEWNKLSE	EQKKPYYDEA	QKIKEKHREE
FPGWVYQPRP	GKRKRFPLSV	SNVFSGTTQN	IISTNPTTVY	PYRSPTYSVV
IPSLQNPITH	PVGETSPAIQ	LPTPAVQSPS	PVTLFQPSVS	SAAQVAVQDP
SLPVYPALPP	QRFTGPSQTD	THQLHSEATH	TVKQPTPVSL	ESANRISSSA
STAHARFATS	TIQPPREYSS	VSPCPRSAPI	PQASPIPHPH	VYQPPPLGHP
ATLFGTPPRF	SFHHPYFLPG	PHYFPSSTCP	YSRPPFGYGN	FPSSMPECLS
YYEDRYPKHE	GIFSTLNRDY	SFRDYSSECT	HSENSRSCEN	MNGTSYYNSH
SHSGEENLNP	VPQLDIGTLE	NVFTAPTSTP	SSIQQVNVTD	SDEEEEEKVL
RDL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30635 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O94993 (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2016. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30635 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, O94993 (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2016. Процитовано 5 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]