NFIC

NFIC
Ідентифікатори
Символи	NFIC, CTF, CTF5, NF-I, NFI, nuclear factor I C
Зовнішні ІД	OMIM: 600729 MGI: 109591 HomoloGene: 4088 GeneCards: NFIC
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • зв'язування з ДНК • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • зв’язування дволанцюгових ДНК • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • клітинне ядро • fibrillar center Біологічний процес • odontogenesis of dentin-containing tooth • реплікація ДНК • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • ДНК-матрична транскрипція • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4782	18029
Ensembl	ENSG00000141905	ENSMUSG00000055053
UniProt	P08651	P70255
RefSeq (мРНК)	NM_001245002 NM_001245004 NM_001245005 NM_005597 NM_205843	NM_008688 NM_026756
RefSeq (білок)	NP_001231931 NP_001231933 NP_001231934 NP_005588 NP_995315	NP_032714 NP_081032
Локус (UCSC)	Хр. 19: 3.31 – 3.47 Mb	Хр. 10: 81.23 – 81.29 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NFIC (англ. Nuclear factor I C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 508 амінокислот, а молекулярна маса — 55 675.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYSSPLCLTQ		DEFHPFIEAL		LPHVRAFAYT		WFNLQARKRK		YFKKHEKRMS
KDEERAVKDE		LLGEKPEVKQ		KWASRLLAKL		RKDIRPECRE		DFVLSITGKK
APGCVLSNPD		QKGKMRRIDC		LRQADKVWRL		DLVMVILFKG		IPLESTDGER
LVKAAQCGHP		VLCVQPHHIG		VAVKELDLYL		AYFVRERDAE		QSGSPRTGMG
SDQEDSKPIT		LDTTDFQESF		VTSGVFSVTE		LIQVSRTPVV		TGTGPNFSLG
ELQGHLAYDL		NPASTGLRRT		LPSTSSSGSK		RHKSGSMEED		VDTSPGGDYY
TSPSSPTSSS		RNWTEDMEGG		ISSPVKKTEM		DKSPFNSPSP		QDSPRLSSFT
QHHRPVIAVH		SGIARSPHPS		SALHFPTTSI		LPQTASTYFP		HTAIRYPPHL
NPQDPLKDLV		SLACDPASQQ		PGPLNGSGQL		KMPSHCLSAQ		MLAPPPPGLP
RLALPPATKP		ATTSEGGATS		PTSPSYSPPD		TSPANRSFVG		LGPRDPAGIY
QAQSWYLG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, реплікація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Santoro C., Mermod N., Andrews P.C., Tjian R. (1988). A family of human CCAAT-box-binding proteins active in transcription and DNA replication: cloning and expression of multiple cDNAs. Nature. 334: 218—224. PMID 3398920 doi:10.1038/334218a0
• Wenzelides S., Altmann S., Wendler W., Winnacker E.L. (1996). CTF5 -- a new transcriptional activator of the NFI/CTF family. Nucleic Acids Res. 24: 2416—2421. PMID 8710515 doi:10.1093/nar/24.12.2416
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19