HOXB6

HOXB6
Ідентифікатори
Символи	HOXB6, HOX2, HOX2B, HU-2, Hox-2.2, homeobox B6
Зовнішні ІД	OMIM: 142961 MGI: 96187 HomoloGene: 7366 GeneCards: HOXB6
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • зв'язування з ДНК • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми • RNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • embryonic skeletal system morphogenesis • розвиток багатоклітинного організму • erythrocyte homeostasis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ДНК-матрична транскрипція • anterior/posterior pattern specification • embryonic skeletal system development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 регуляція транскрипції РНК-полімеразою II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3216	15414
Ensembl	ENSG00000108511	ENSMUSG00000000690
UniProt	P17509	P09023
RefSeq (мРНК)	NM_018952 NM_156036 NM_156037 NM_001369397	NM_008269
RefSeq (білок)	NP_061825 NP_001356326	NP_032295
Локус (UCSC)	Хр. 17: 48.6 – 48.6 Mb	Хр. 11: 96.18 – 96.19 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HOXB6 (англ. Homeobox B6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 224 амінокислот, а молекулярна маса — 25 432.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSYFVNSTF		PVTLASGQES		FLGQLPLYSS		GYADPLRHYP		APYGPGPGQD
KGFATSSYYP		PAGGGYGRAA		PCDYGPAPAF		YREKESACAL		SGADEQPPFH
PEPRKSDCAQ		DKSVFGETEE		QKCSTPVYPW		MQRMNSCNSS		SFGPSGRRGR
QTYTRYQTLE		LEKEFHYNRY		LTRRRRIEIA		HALCLTERQI		KIWFQNRRMK
WKKESKLLSA		SQLSAEEEEE		KQAE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Shen W.-F., Detmer K., Simonitch-Eason T.A., Lawrence H.J., Largman C. (1991). Alternative splicing of the HOX 2.2 homeobox gene in human hematopoietic cells and murine embryonic and adult tissues. Nucleic Acids Res. 19: 539—545. PMID 1672751 doi:10.1093/nar/19.3.539
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Levine M., Rubin G.M., Tjian R. (1984). Human DNA sequences homologous to a protein coding region conserved between homeotic genes of Drosophila. Cell. 38: 667—673. PMID 6091895 doi:10.1016/0092-8674(84)90261-7

Див. також

• Хромосома 17