ECM1

ECM1
Ідентифікатори
Символи	ECM1, URBWD, extracellular matrix protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602201 MGI: 103060 HomoloGene: 3260 GeneCards: ECM1
Пов'язані генетичні захворювання
Хвороба Урбаха — Віте
Онтологія гена Молекулярна функція • interleukin-2 receptor binding • signal transducer activity • зв'язування з протеазами • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми • enzyme binding • laminin binding Клітинна компонента • GO:0005578 позаклітинний матрикс • екзосома • extracellular region • platelet dense granule lumen • міжклітинний простір Біологічний процес • regulation of T cell migration • негативна регуляція пептидазної активності • negative regulation of bone mineralization • positive regulation of endothelial cell proliferation • осифікація • regulation of bone mineralization • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 регуляція транскрипції РНК-полімеразою II • biomineral tissue development • negative regulation of cytokine-mediated signaling pathway • positive regulation of angiogenesis • Ангіогенез • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • inflammatory response • regulation of type 2 immune response • дегрануляція тромбоцитів • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1893	13601
Ensembl	ENSG00000143369	ENSMUSG00000028108
UniProt	Q16610	Q61508
RefSeq (мРНК)	NM_022664 NM_001202858 NM_004425	NM_001252653 NM_007899 NM_001355070
RefSeq (білок)	NP_001189787 NP_004416 NP_073155	NP_001239582 NP_031925 NP_001341999
Локус (UCSC)	Хр. 1: 150.51 – 150.51 Mb	Хр. 3: 95.64 – 95.65 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ECM1 (англ. Extracellular matrix protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 540 амінокислот, а молекулярна маса — 60 674.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGTTARAALV		LTYLAVASAA		SEGGFTATGQ		RQLRPEHFQE		VGYAAPPSPP
LSRSLPMDHP		DSSQHGPPFE		GQSQVQPPPS		QEATPLQQEK		LLPAQLPAEK
EVGPPLPQEA		VPLQKELPSL		QHPNEQKEGT		PAPFGDQSHP		EPESWNAAQH
CQQDRSQGGW		GHRLDGFPPG		RPSPDNLNQI		CLPNRQHVVY		GPWNLPQSSY
SHLTRQGETL		NFLEIGYSRC		CHCRSHTNRL		ECAKLVWEEA		MSRFCEAEFS
VKTRPHWCCT		RQGEARFSCF		QEEAPQPHYQ		LRACPSHQPD		ISSGLELPFP
PGVPTLDNIK		NICHLRRFRS		VPRNLPATDP		LQRELLALIQ		LEREFQRCCR
QGNNHTCTWK		AWEDTLDKYC		DREYAVKTHH		HLCCRHPPSP		TRDECFARRA
PYPNYDRDIL		TIDIGRVTPN		LMGHLCGNQR		VLTKHKHIPG		LIHNMTARCC
DLPFPEQACC		AEEEKLTFIN		DLCGPRRNIW		RDPALCCYLS		PGDEQVNCFN
INYLRNVALV		SGDTENAKGQ		GEQGSTGGTN		ISSTSEPKEE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як ангіогенез, остеогенез, мінеральний обмін, поліморфізм. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1