RRH

RRH
Ідентифікатори
Символи	RRH, retinal pigment epithelium-derived rhodopsin homolog
Зовнішні ІД	OMIM: 605224 MGI: 1097709 HomoloGene: 55977 GeneCards: RRH
Онтологія гена Молекулярна функція • photoreceptor activity • signal transducer activity • G protein-coupled receptor activity • G protein-coupled photoreceptor activity Клітинна компонента • інтегральний компонент мембрани • інтегральний компонент плазматичної мембрани • мембрана • зовнішній сегмент фоторецептора Біологічний процес • GO:0072468 сигнальна трансдукція • відповідь на стимул • зріння (видіннє) • G protein-coupled receptor signaling pathway • phototransduction • detection of visible light • cellular response to light stimulus Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10692	20132
Ensembl	ENSG00000180245	ENSMUSG00000028012
UniProt	O14718	O35214
RefSeq (мРНК)	NM_006583	NM_009102
RefSeq (білок)	NP_006574	NP_033128
Локус (UCSC)	Хр. 4: 109.83 – 109.85 Mb	Хр. 3: 129.6 – 129.62 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RRH (англ. Retinal pigment epithelium-derived rhodopsin homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 337 амінокислот, а молекулярна маса — 37 423.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLRNNLGNSS		DSKNEDGSVF		SQTEHNIVAT		YLIMAGMISI		ISNIIVLGIF
IKYKELRTPT		NAIIINLAVT		DIGVSSIGYP		MSAASDLYGS		WKFGYAGCQV
YAGLNIFFGM		ASIGLLTVVA		VDRYLTICLP		DVGRRMTTNT		YIGLILGAWI
NGLFWALMPI		IGWASYAPDP		TGATCTINWR		KNDRSFVSYT		MTVIAINFIV
PLTVMFYCYY		HVTLSIKHHT		TSDCTESLNR		DWSDQIDVTK		MSVIMICMFL
VAWSPYSIVC		LWASFGDPKK		IPPPMAIIAP		LFAKSSTFYN		PCIYVVANKK
FRRAMLAMFK		CQTHQTMPVT		SILPMDVSQN		PLASGRI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу. Білок має сайт для зв'язування з хромофором. Локалізований у мембрані.

Література

• Sun H., Gilbert D.J., Copeland N.G., Jenkins N.A., Nathans J. (1997). Peropsin, a novel visual pigment-like protein located in the apical microvilli of the retinal pigment epithelium. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 9893—9898. PMID 9275222 doi:10.1073/pnas.94.18.9893
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Bellingham J., Wells D.J., Foster R.G. (2003). In silico characterisation and chromosomal localisation of human RRH (peropsin) -- implications for opsin evolution. BMC Genomics. 4: 3—3. PMID 12542842 doi:10.1186/1471-2164-4-3

Див. також

• Хромосома 4