TLR9

TLR9
Ідентифікатори
Символи	TLR9, CD289, toll like receptor 9
Зовнішні ІД	OMIM: 605474 MGI: 1932389 HomoloGene: 68126 GeneCards: TLR9
Реагує на сполуку
	гідроксихлорохін, agatolimod sodium
Онтологія гена
Молекулярна функція	• siRNA binding; • interleukin-1 receptor binding; • активність трансмембранного сигнального рецептора; • 1-phosphatidylinositol-3-kinase activity; • гомодимеризація білків; • unmethylated CpG binding; • GO:0008329 pattern recognition receptor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • інтегральний компонент мембрани; • ендосома; • мембрана ендоплазматичного ретикулуму; • мембрана; • early phagosome; • Golgi membrane; • клітинна мембрана; • extracellular region; • basolateral plasma membrane; • apical plasma membrane; • ендоплазматичний ретикулум; • phagocytic vesicle; • endolysosome membrane; • лізосома; • endosome membrane; • GO:0016023 цитоплазматичний міхур; • міжклітинний простір; • endolysosome;
Біологічний процес	• positive regulation of interleukin-18 production; • positive regulation of toll-like receptor signaling pathway; • positive regulation of inflammatory response; • positive regulation of interleukin-12 production; • аксоноґенеза; • positive regulation of interleukin-10 production; • процес імунної системи; • positive regulation of JUN kinase activity; • negative regulation of interleukin-6 production; • I-kappaB phosphorylation; • positive regulation of JNK cascade; • positive regulation of nitric-oxide synthase biosynthetic process; • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway; • negative regulation of interleukin-8 production; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • negative regulation of ATPase-coupled calcium transmembrane transporter activity; • negative regulation of toll-like receptor signaling pathway; • defense response to bacterium; • maintenance of gastrointestinal epithelium; • positive regulation of granulocyte macrophage colony-stimulating factor production; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • positive regulation of interleukin-8 production; • positive regulation of interleukin-6 production; • positive regulation of tumor necrosis factor production; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • positive regulation of chemokine production; • tumor necrosis factor production; • toll-like receptor 9 signaling pathway; • вроджений імунітет; • inflammatory response; • response to molecule of bacterial origin; • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • positive regulation of interferon-beta production; • toll-like receptor signaling pathway; • phosphatidylinositol-3-phosphate biosynthetic process; • positive regulation of immunoglobulin production; • positive regulation of B cell proliferation; • regulation of toll-like receptor 9 signaling pathway; • positive regulation of MAPK cascade; • regulation of B cell differentiation; • positive regulation of B cell activation; • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • defense response to virus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	54106
	81897
	ENSG00000239732
	ENSMUSG00000045322
	Q9NR96
	Q9EQU3
	NM_138688; NM_017442
	NM_031178
	NP_059138
	NP_112455
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TLR9 (англ. Toll like receptor 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 032 амінокислот, а молекулярна маса — 115 860^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGFCRSALHP	LSLLVQAIML	AMTLALGTLP	AFLPCELQPH	GLVNCNWLFL
KSVPHFSMAA	PRGNVTSLSL	SSNRIHHLHD	SDFAHLPSLR	HLNLKWNCPP
VGLSPMHFPC	HMTIEPSTFL	AVPTLEELNL	SYNNIMTVPA	LPKSLISLSL
SHTNILMLDS	ASLAGLHALR	FLFMDGNCYY	KNPCRQALEV	APGALLGLGN
LTHLSLKYNN	LTVVPRNLPS	SLEYLLLSYN	RIVKLAPEDL	ANLTALRVLD
VGGNCRRCDH	APNPCMECPR	HFPQLHPDTF	SHLSRLEGLV	LKDSSLSWLN
ASWFRGLGNL	RVLDLSENFL	YKCITKTKAF	QGLTQLRKLN	LSFNYQKRVS
FAHLSLAPSF	GSLVALKELD	MHGIFFRSLD	ETTLRPLARL	PMLQTLRLQM
NFINQAQLGI	FRAFPGLRYV	DLSDNRISGA	SELTATMGEA	DGGEKVWLQP
GDLAPAPVDT	PSSEDFRPNC	STLNFTLDLS	RNNLVTVQPE	MFAQLSHLQC
LRLSHNCISQ	AVNGSQFLPL	TGLQVLDLSH	NKLDLYHEHS	FTELPRLEAL
DLSYNSQPFG	MQGVGHNFSF	VAHLRTLRHL	SLAHNNIHSQ	VSQQLCSTSL
RALDFSGNAL	GHMWAEGDLY	LHFFQGLSGL	IWLDLSQNRL	HTLLPQTLRN
LPKSLQVLRL	RDNYLAFFKW	WSLHFLPKLE	VLDLAGNQLK	ALTNGSLPAG
TRLRRLDVSC	NSISFVAPGF	FSKAKELREL	NLSANALKTV	DHSWFGPLAS
ALQILDVSAN	PLHCACGAAF	MDFLLEVQAA	VPGLPSRVKC	GSPGQLQGLS
IFAQDLRLCL	DEALSWDCFA	LSLLAVALGL	GVPMLHHLCG	WDLWYCFHLC
LAWLPWRGRQ	SGRDEDALPY	DAFVVFDKTQ	SAVADWVYNE	LRGQLEECRG
RWALRLCLEE	RDWLPGKTLF	ENLWASVYGS	RKTLFVLAHT	DRVSGLLRAS
FLLAQQRLLE	DRKDVVVLVI	LSPDGRRSRY	VRLRQRLCRQ	SVLLWPHQPS
GQRSFWAQLG	MALTRDNHHF	YNRNFCQGPT	AE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, ендосомах.

Література

Georgel P., Macquin C., Bahram S. (2009). The heterogeneous allelic repertoire of human Toll-Like receptor (TLR) genes. PLoS ONE. 4: E7803—E7803. PMID 19924287 doi:10.1371/journal.pone.0007803
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Doyle S.L., Jefferies C.A., Feighery C., O'Neill L.A. (2007). Signaling by Toll-like receptors 8 and 9 requires Bruton's tyrosine kinase. J. Biol. Chem. 282: 36953—36960. PMID 17932028 doi:10.1074/jbc.M707682200
Du X., Poltorak A., Wei Y., Beutler B. (2000). Three novel mammalian Toll-like receptors: gene structure, expression, and evolution. Eur. Cytokine Netw. 11: 362—371. PMID 11022119
Chuang T.-H., Ulevitch R.J. (2000). Cloning and characterization of a sub-family of human Toll-like receptors: hTLR7, hTLR8 and hTLR9. Eur. Cytokine Netw. 11: 372—378. PMID 11022120

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Toll like receptor 9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15633 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9NR96 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Toll like receptor 9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15633 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q9NR96 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

п о р Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350