Made a bunch of tinymce 6 upgrade fixes

- Added workaround for new 'srcdoc' usage that's breaking content in
  Firefox, added new 'custom-changes.md' file to document for future.
- Updated old usages of 'new' when creating nodes.
- Tested and changed logic, where required, where 'editor.dom.select'
  has been used to replace the old '$' usages.
- Fixed bad boolean value being passed to 'setActive' in task list
  logic.

Started upgrade to TinyMCE6, Untested

- Merged in latest TinyMCE code.
- Gone through tinymce upgrade guide, made required config changes.
- Altered license references.

Merge pull request #3579 from BookStackApp/dompdf_and_php_deps

Updated DOMPDF, and other PHP dependancies

Fixed failing tests from dompdf chanages

Updated DOMPDF, and other PHP dependancies

Added "ACTIVITY_LOGGED" theme event

Closes #3572

Re-ordered theme events to be alphabetical

Merge pull request #3569 from BookStackApp/permissions_v2

Permissions System Refactor

Applied StyleCI changes

Removed test web route, extracted text, added test

Dropped use of non-view joint permissions

Fixed a couple of non-intended logical permission issues

Both caught in tests:
Fixed loss of permissions for admin users when entity restrictions were
active, since there are no entity-restrictions for the admin role but
we'd force generate them in joint permissions, which would be queried.
Fixed new role permission checks when permissions given with only the
action (eg. 'view'), since the type prefix would be required for role
permission checks. Was previously not needed as only the simpler form
was used in the jointpermissions after merge & calculation.

Aligned permission applicator method names

Also removed lesser used function, that was mostly a duplicate of an
existing function, and only used for search.

Removed remaining dynamic action usages in joint permission queries

Continued removal of joint permission non-view queries

Cleaned up PermissionApplicator to remove old cache system which was
hardly ever actuall caching anything since it was reset after each
public method run.

Changed the scope of 'userCanOnAny' to just check entity permissions,
and added protections of action scope creep, in case a role permission
action was passed by mistake.

Merge pull request #3573 from BookStackApp/m1_docker_support

M1/Apple Silicon dev docker compatibility

Tweaked docker dev container to work with m1 apple silicon

Tested on m1 macbook, needs testing on amd64

Started removal of non-view permission queries

Updated ajax search and entity selector usage to display and handle
items that the user does not have permission to interact with.
Started logic changes to not allow permission type to be passed around,
with views instead being the fixed sole permission.

Added simple data model for faster permission generation

Renamed and cleaned up existing permission service classes use

Extracted permission building out of permission service

Optimized pre-joint-permission logic efficiency

New Crowdin updates (#3540)

Merge branch '3535-group-sync-fix' into development

New Crowdin updates (#3531)

Aligned entity-selector-popup button and dblclick behaviour

Fixes #3534

Auth group sync: Fixed unintential mapping behaviour change

Due to change in how casing was handled when used in the "External Auth
ID" role field.
Likely related to #3535.
Added test to cover.

Added path example to visual theme system

Merge branch 'development' of github.com:BookStackApp/BookStack into development

Applied StyleCI changes

New Crowdin updates (#3526)

Fixed non-translated category strings

For #3529

Updated entity-selector-popup to reset on selection

Better links the core selector component to the popup version, with new
public methods for direct controlling.

For #3528

Fixed grid layouts being pushed out by child content

Ran a quick app run-thorugh in FireFox & Chrome, No secondary affects
immediately noticed but possible this could cause changes elsewhere due
to wide-spread grid item child targeting.

For #3523

Fixed issue blocking tags on book update

For #3527

Added missing welsh locale to config

New Crowdin updates (#3428)

Updated translator list before v22.06 release

Updated php deps and applied styleci changes

Added base template convenience partials for theme system users

Included test to cover usage and paths.
Closes #894

Merge branch 'login-auto-redirect' into development

Review and update of login auto initiation PR

For PR #3406

- Updated naming from 'redirect' to 'initate/initation'.
- Updated phpunit.xml and .env.example.complete files with the new
  option.
- Cleaned up controller logic a bit.
- Added content and design to the new initation view to not leave user
  on a blank view for a while.
- Added non-JS button to initiation view as fallback option for
  progression.
- Moved new test to it's own Test class and expanded with additional
  scenario tests for better functionality coverage.

Fixed code snippets being added as single line

TinyMCE was adding attributes to <br> elements within code blocks which
would then not be converted to newlines by our code regex match.
This changes the conversion to use dom querying instead.

Fixes #3507

Fixed issue where text after line breaks not indexed

Linebreaks would previously essentially be removed during index and
hence joined to adjacent words, breaking prefix matching.
Added test to cover.
For #3508

Merge pull request #3512 from BookStackApp/code_manager_updates

WYSIWYG Code Editor Updates

Added code editor changes mobile design handling

Adjusted code manager changes for dark mode

Aligned other popup windows

Primary change was altering image-manager to use same footer bar style
as other windows.

Updated code editor language lists

To align and update supported languages.

Related to #3511 and #3494

Tweaked code editor sidebar side to be smaller

Polished up code editor design

Started design changes to the code-editor

Merge pull request #3499 from BookStackApp/convert_hierachy

Chapter and Book Conversion Actions

Removed bad trailing comma in method

Fixed failing tests after conversion changes

Applied styleci changes for conversion work

Added tests for content conversion action permissions

- Updated 'removePermissionFromUser' test helper to work for
  entity-permissions that become part of the joint permissions system.

Added tests and doc updates for shelf/book cover image API abilities

Added tests to cover convert functionality

Also updated cloner class with typed properties.

Extracted conversion text to translation file

Merge pull request #3503 from andrii-bodnar/fix/crowdin-name

Fix Crowdin name in the language_request issue template

Fix Crowdin name in the language_request issue template

Got book to shelf conversions working

- Also extracted shelf to book view elements to own partial.
- Fixed some existing logic including image param handling in update
  request and activity logging against correct element.

Got chapter conversion to books working

- Added required UI within edit view.
- Added required routes and controller actions.

Added clone of entity permissions on chapter/book promotion

Started work on hierachy conversion actions

- Updates book/shelf cover image handling for easier cloning/handling.
- Adds core logic for promoting books/chapters up a level.
- Enables usage of book/shelf cover image via API.

Related to #1087

Applied styleci changes, updated composer deps

Extracted download response logic to its own class

Cleans up base controller and groups up download & streaming logic for
potential future easier addition of range request support.

Added audio mimes to our safe list for inline serving

Closes #3485

Updated composer deps, applied styleci changes

Reorganised and split out export templates & styles

Moved export templates elements into their own folder for better
grouping of logical usage.
Within the base export template, added some body classes to allow easier
targeted customisation via custom head css.
Split content of export templates into smaller partials for easier
future customization.

Closes #3443

Updated markdown preview to update on diff-basis

Uses vdom system to diff and update the current markdown preview view
instead of requiring a full HTML replace change.
This should provide better performance, expecially where dynamically
loaded content such as iframes were in use.

Closes #3454

Updated image drop handling to respect original file name

Now uses the previously timestamp gen name as a backup to the original
name. Aligns with the image manager upload which uses the original name
where given.

Closes #3470

Removed `image_id` property from books & shelves api docs

This was either not provided or not provided for the last 18 months.
Likely not providing much value as-is so removing.

Closes #3474

Added codeblock latex/stext support

For #3458

Prevented inadvertant logging during MFA flow

- Added StoppedAuthenticationException to dontReport list.
- Added test to cover.

Closes #3468

Merge branch 'development' of github.com:BookStackApp/BookStack into development

Updated JS deps

Update dev version to track current release target

Merge pull request #3416 from BookStackApp/group_sync_comma_escaping

Added ability to escape role "External Auth ID" commas

Merge pull request #3433 from BookStackApp/tiny_improvements

Bunch of tiny improvements

Updated funding with kofi link

Updated PHP deps

Updated attachment links to have dropdown for open type

- Allows easier accessibility of inline attachments.
- Introduces a new split-icon-list-item thingy to support such cases
  where only part of the button is actually linked.

Made chapter toggle in book sidebar nav more consistent

- Now has a hover state to match other items.
- Now spans the full sidebar with like other items.
- Also updated chapter-toggle to a chapter-contents component, following
  the newer component system.

Readjusted book child item styles after other changes

Was extra space showing due to structure changes and flex gap.

Tweaked chapter list item styles

- Improves animation smoothness
- Changed animation slideup/down animations to use max-height instead of height
  to better avoid jutter at the end.
- Cleaned spacing to match page items in books listing.

Made the "Custom HTML Head Content" setting a highlighted code editor

Aligned collapsed header dropdown item styles

Previously the desktop-visible items would style different when collapsed
into the expanded dropdown menu, compared to existing items.

Refined header bar styles

- Updated many items to be flexbox-based.
- Updated & aligned hover states across header bar items.

Fixed some inputs affected by height changes

Fixed entity-specific tag counts listing

Was reporting wrong due to use of old polymorphic namespace references.
Test was not picking up as assertElementContains had wider scope than
expected, looking within the HTML of the element instead of the text
which you might expect. Updated test helper to look at text instead.

Removed dialog debug script from default home

Accidentally left in from before.
Closes #3430

Improved input size consistency

Specifically updates dropdown search and user-search implementation,
although does affect all inputs.
Decouples breadcrum and select-style dropdown search toggles.

Addresses #2678

Updated dropdown search boxe positions to align with other dropdowns

Fixed skip-to-content link shadow being slightly visible

Would cause a slight dark area in top left of view while hidden.

Updated tri-layout sidebars to not be cut-off by padding

Would cause effect where scroll area would be cut of by spacing which
looked a bit strange. This retains the same padding sizes but cuts the
content at the header or top of viewport.

Added animation transition for breadcrumb dropdown load

Animates the height on breadcrumb dropdown menus to transition to the
loaded animations quicker. Includes a new animation helper for doing
similar tasks in future.

Fixed loading animation delay

Loading animation would show in an unready state due to animation-delay
on components. Updated to a negative delay to ensure elements were in
correct positions right away upon show.

Updated breadcrumb dropdown styles, improved keyboard nav

- Removed harsh theme color border between search and content.
- Prevented intermediate focus on list container to align arrow & tab
  behaviour, and to get to content quicker.